More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2128 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2128  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
365 aa  723    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  43.24 
 
 
458 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  41 
 
 
464 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  42.42 
 
 
450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  45.59 
 
 
436 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  37.9 
 
 
434 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  37.9 
 
 
434 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  41.4 
 
 
443 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  39.7 
 
 
464 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  39.11 
 
 
440 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  40.18 
 
 
438 aa  246  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  42.69 
 
 
421 aa  244  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  40.61 
 
 
442 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  38.39 
 
 
434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  40.48 
 
 
443 aa  243  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  39.7 
 
 
434 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  37.35 
 
 
441 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  39.88 
 
 
398 aa  239  5e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  38.02 
 
 
442 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  39.1 
 
 
434 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  40.71 
 
 
446 aa  236  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  44.08 
 
 
446 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  40.5 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  38.86 
 
 
430 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  41.36 
 
 
432 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  43.03 
 
 
441 aa  233  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  40.6 
 
 
454 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  40.77 
 
 
449 aa  226  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  38.51 
 
 
443 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  37.8 
 
 
436 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  38.58 
 
 
434 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  40.38 
 
 
432 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  40.96 
 
 
446 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  42.3 
 
 
422 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.99 
 
 
429 aa  220  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  38.48 
 
 
426 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  39.02 
 
 
418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  38.72 
 
 
418 aa  219  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  38.92 
 
 
434 aa  219  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  39.43 
 
 
432 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  38.2 
 
 
431 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  38.48 
 
 
422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.83 
 
 
461 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  40 
 
 
421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  40.91 
 
 
443 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  40.91 
 
 
443 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  38.92 
 
 
420 aa  216  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  38.18 
 
 
422 aa  215  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 
340 aa  215  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  38.48 
 
 
418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  37.95 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  38.3 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  38.48 
 
 
418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  38.48 
 
 
418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  38.48 
 
 
418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  38.48 
 
 
418 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  38.48 
 
 
418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  35.91 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  38.48 
 
 
418 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  39.21 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  38.48 
 
 
418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  34.74 
 
 
444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  38.48 
 
 
418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  41.67 
 
 
432 aa  213  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  38.3 
 
 
425 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  41.64 
 
 
439 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  38.74 
 
 
419 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  37.99 
 
 
425 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  35.88 
 
 
418 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  38.3 
 
 
425 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  42.95 
 
 
427 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  38.97 
 
 
418 aa  210  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  37.99 
 
 
425 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  37.88 
 
 
418 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  37.88 
 
 
418 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  38.3 
 
 
425 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  37.88 
 
 
418 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  37.88 
 
 
418 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  35.65 
 
 
444 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  35.65 
 
 
444 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  37.58 
 
 
418 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  37.39 
 
 
434 aa  209  9e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  35.65 
 
 
444 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  35.65 
 
 
444 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  35.65 
 
 
444 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  37.2 
 
 
416 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  35.65 
 
 
444 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.69 
 
 
423 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  35.95 
 
 
444 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  35.65 
 
 
444 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 
426 aa  208  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  36.53 
 
 
422 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  35.65 
 
 
444 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  37.08 
 
 
436 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  36.25 
 
 
416 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  38.35 
 
 
425 aa  206  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  37.46 
 
 
420 aa  206  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  33.63 
 
 
426 aa  206  7e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  36.56 
 
 
416 aa  205  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  35.35 
 
 
443 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>