More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03645 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03645  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 422 aa  856    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0942  glutamyl-tRNA reductase  67.25 
 
 		 416 aa  552  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1456  glutamyl-tRNA reductase  61.76 
 
 		 414 aa  530  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3752  glutamyl-tRNA reductase  60.83 
 
 		 434 aa  525  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6499  glutamyl-tRNA reductase  44.03 
 
 		 440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2489  glutamyl-tRNA reductase  31.33 
 
 		 419 aa  225  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  32.6 
 
 		 441 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  30.33 
 
 		 443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0333  glutamyl-tRNA reductase  29.4 
 
 		 425 aa  192  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3619  glutamyl-tRNA reductase  30.83 
 
 		 432 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  0.597064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  28.68 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  29.58 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  29.16 
 
 		 453 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  28.68 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  28.42 
 
 		 428 aa  186  7e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.66 
 
 		 423 aa  186  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  26.89 
 
 		 428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  26.89 
 
 		 428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  27.12 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  30.38 
 
 		 418 aa  180  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  26.95 
 
 		 431 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  28.12 
 
 		 464 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  26.89 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  26.89 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  28.5 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  29.88 
 
 		 426 aa  177  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  27.4 
 
 		 425 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  28.24 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  26.78 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  28.3 
 
 		 464 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  26.05 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  29.66 
 
 		 426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  28.77 
 
 		 419 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  29.67 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  27.17 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  26.78 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  26.67 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  30.83 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  25.24 
 
 		 430 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  26.93 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  25.65 
 
 		 436 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  27.73 
 
 		 454 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  27.25 
 
 		 438 aa  172  9e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  26.48 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  30.33 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  26.93 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  27.93 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  28 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  27.06 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  26.09 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  31.06 
 
 		 418 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  24.88 
 
 		 458 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  27.46 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  27.46 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  27.7 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  28.14 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  27.46 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  27.46 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  31.12 
 
 		 398 aa  170  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  28.71 
 
 		 434 aa  169  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  28.17 
 
 		 444 aa  169  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  27.32 
 
 		 420 aa  169  8e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  28.54 
 
 		 512 aa  169  9e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  30.92 
 
 		 418 aa  169  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0934  glutamyl-tRNA reductase  30.09 
 
 		 426 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  26.9 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.97 
 
 		 419 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  28.42 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  26.82 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  26.9 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  27.23 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  25.76 
 
 		 422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  27.23 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  30.42 
 
 		 418 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2065  glutamyl-tRNA reductase  25.61 
 
 		 431 aa  167  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0581  glutamyl-tRNA reductase  27.12 
 
 		 435 aa  167  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  25.76 
 
 		 422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  25.48 
 
 		 442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  30.3 
 
 		 418 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  30.3 
 
 		 418 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  30.3 
 
 		 418 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  30.3 
 
 		 418 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  26.73 
 
 		 443 aa  166  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  30.56 
 
 		 418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  27.59 
 
 		 458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  30.56 
 
 		 418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  30.05 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  27.92 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  26.71 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  29.83 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  24.58 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1795  glutamyl-tRNA reductase  30.59 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  27.38 
 
 		 446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  28.42 
 
 		 441 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0118  glutamyl-tRNA reductase  25.63 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000526977  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  30.3 
 
 		 418 aa  163  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  30.3 
 
 		 418 aa  163  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  30.3 
 
 		 418 aa  163  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  30.3 
 
 		 418 aa  163  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0951  glutamyl-tRNA reductase  29.62 
 
 		 425 aa  163  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>