More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3752 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3752  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 434 aa  889    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0942  glutamyl-tRNA reductase  71.67 
 
 		 416 aa  604  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03645  glutamyl-tRNA reductase  60.83 
 
 		 422 aa  525  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1456  glutamyl-tRNA reductase  58.33 
 
 		 414 aa  513  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6499  glutamyl-tRNA reductase  42.18 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2489  glutamyl-tRNA reductase  34.28 
 
 		 419 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0333  glutamyl-tRNA reductase  34.11 
 
 		 425 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3619  glutamyl-tRNA reductase  34.62 
 
 		 432 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  0.597064 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  30.58 
 
 		 441 aa  200  5e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  29.79 
 
 		 434 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  29.95 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  28.54 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  29.01 
 
 		 426 aa  186  8e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  27.27 
 
 		 431 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  30.08 
 
 		 436 aa  183  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  30.62 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  29.37 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  30.42 
 
 		 434 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  27.29 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  30.17 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  29.15 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1892  glutamyl-tRNA reductase  30.55 
 
 		 460 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  31.87 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  29.75 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  28.76 
 
 		 464 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  29.16 
 
 		 425 aa  173  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.55 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  29.1 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0894  glutamyl-tRNA reductase  29.63 
 
 		 423 aa  171  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  26.91 
 
 		 440 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  26.21 
 
 		 440 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  28.31 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1426  glutamyl-tRNA reductase  30.54 
 
 		 425 aa  170  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  25.84 
 
 		 430 aa  170  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  30.26 
 
 		 420 aa  169  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0851  glutamyl-tRNA reductase  27.86 
 
 		 426 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1795  glutamyl-tRNA reductase  29.66 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0951  glutamyl-tRNA reductase  29.1 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0934  glutamyl-tRNA reductase  30.86 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  28.22 
 
 		 425 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  30.73 
 
 		 434 aa  167  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.34 
 
 		 419 aa  167  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  29.26 
 
 		 444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  28.99 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  28.99 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  28.99 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  28.99 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  28.99 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  28.99 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  28.99 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  27.82 
 
 		 422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  28.72 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  28.99 
 
 		 444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  30.89 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  28.99 
 
 		 444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  29.06 
 
 		 449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  30.89 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  28.75 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  28.78 
 
 		 414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  30.58 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  30.58 
 
 		 418 aa  163  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  27.25 
 
 		 428 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  30.58 
 
 		 425 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  29.37 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  25.29 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  24.55 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  29.36 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  25.53 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  31.71 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  28.13 
 
 		 443 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  31.56 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  27.75 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  27.5 
 
 		 443 aa  160  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  26.48 
 
 		 438 aa  160  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  29.25 
 
 		 418 aa  160  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  28.45 
 
 		 418 aa  160  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  29.69 
 
 		 432 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  27.45 
 
 		 428 aa  159  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 453 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  29.77 
 
 		 418 aa  159  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  25.44 
 
 		 418 aa  159  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  29.77 
 
 		 418 aa  159  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  25.61 
 
 		 442 aa  159  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  29.25 
 
 		 418 aa  159  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  28.53 
 
 		 441 aa  159  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0581  glutamyl-tRNA reductase  25.88 
 
 		 435 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  27.72 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  28.85 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  26.98 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  26.97 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  29.52 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  29.52 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  29.64 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  29.52 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  26.27 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  29.52 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  26.46 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  29.52 
 
 		 418 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  28.99 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>