More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1892 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1892  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 460 aa  923    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  34.68 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  33.08 
 
 		 464 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3619  glutamyl-tRNA reductase  32.19 
 
 		 432 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  0.597064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  34 
 
 		 428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1456  glutamyl-tRNA reductase  30.02 
 
 		 414 aa  196  8.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.98 
 
 		 461 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  31.11 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  32.19 
 
 		 435 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  32.59 
 
 		 436 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  34.64 
 
 		 434 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 426 aa  192  9e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 458 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0333  glutamyl-tRNA reductase  30.35 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  35.54 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  35.15 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  34.4 
 
 		 434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  34.41 
 
 		 434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  33.5 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  34.39 
 
 		 432 aa  190  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  33.5 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 		 428 aa  190  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2489  glutamyl-tRNA reductase  30.86 
 
 		 419 aa  190  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  33.92 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  33.91 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  32.84 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  34.16 
 
 		 442 aa  187  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  29.91 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  36.12 
 
 		 425 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  33.66 
 
 		 434 aa  186  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  30.79 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3752  glutamyl-tRNA reductase  30.55 
 
 		 434 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  31.98 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  33.09 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  30.79 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  30.54 
 
 		 436 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  32.08 
 
 		 430 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  35.5 
 
 		 440 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  31.03 
 
 		 428 aa  182  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  32.49 
 
 		 443 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  33.42 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0934  glutamyl-tRNA reductase  32.22 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  32.19 
 
 		 441 aa  181  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  31.83 
 
 		 441 aa  180  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  33.92 
 
 		 440 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  33.75 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  31.94 
 
 		 441 aa  179  9e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  33.66 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  30.36 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08151  glutamyl-tRNA reductase  30.81 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.374123  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  33.09 
 
 		 443 aa  177  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  30.83 
 
 		 443 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  35.94 
 
 		 340 aa  176  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  31.3 
 
 		 431 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  32.28 
 
 		 454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0894  glutamyl-tRNA reductase  31.9 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  31.1 
 
 		 425 aa  173  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  29.62 
 
 		 434 aa  173  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  32.09 
 
 		 420 aa  173  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1426  glutamyl-tRNA reductase  31.43 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  35.75 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0951  glutamyl-tRNA reductase  31.68 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6499  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  31.33 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  32.04 
 
 		 443 aa  171  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  30.84 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  30.84 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  30.84 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  30.84 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  30.84 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  36.21 
 
 		 425 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  31.03 
 
 		 450 aa  170  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1795  glutamyl-tRNA reductase  30.48 
 
 		 425 aa  169  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  30.02 
 
 		 444 aa  169  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  33.8 
 
 		 398 aa  169  8e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  30.02 
 
 		 444 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  30.29 
 
 		 444 aa  169  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  30.6 
 
 		 444 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  30.6 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03645  glutamyl-tRNA reductase  27.62 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  31.68 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  32.31 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  34.67 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  30.6 
 
 		 446 aa  167  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  34.67 
 
 		 446 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  34.67 
 
 		 446 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1553  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 		 429 aa  166  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0851  glutamyl-tRNA reductase  31.68 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  31.85 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>