More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0261 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 435 aa  858    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  67.67 
 
 		 440 aa  562  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  60.78 
 
 		 434 aa  478  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  51.7 
 
 		 477 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  49.8 
 
 		 501 aa  420  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  52.76 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  55.45 
 
 		 440 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  50.23 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  51.36 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  52.67 
 
 		 458 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  49.54 
 
 		 473 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  53 
 
 		 438 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  50.23 
 
 		 457 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  50.46 
 
 		 468 aa  378  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  47.88 
 
 		 473 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  48.74 
 
 		 476 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  52.09 
 
 		 430 aa  372  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  47.75 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  52.84 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  48.86 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  48.86 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  48.86 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  50.12 
 
 		 455 aa  363  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  49.77 
 
 		 455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  46.68 
 
 		 448 aa  344  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  47.44 
 
 		 456 aa  313  4.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  40.83 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.97 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  40.42 
 
 		 446 aa  289  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  38.86 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  38.68 
 
 		 434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  39.34 
 
 		 441 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  37.39 
 
 		 434 aa  276  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  35.15 
 
 		 464 aa  275  9e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  36.98 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  36.36 
 
 		 434 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  36.36 
 
 		 434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  37.62 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  36.41 
 
 		 443 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  35.14 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  35.36 
 
 		 444 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  36.73 
 
 		 438 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  34.6 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  35.78 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  36.02 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  35.45 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  35.45 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  35.45 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  35.45 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 		 443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  35.45 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  35.45 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  35.68 
 
 		 444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  34.81 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  34.81 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  30.79 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.14 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  32.09 
 
 		 458 aa  243  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  36.34 
 
 		 465 aa  238  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  37.3 
 
 		 458 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  36.92 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  32.63 
 
 		 448 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  32.63 
 
 		 448 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  37.29 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  37.35 
 
 		 446 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  37.12 
 
 		 446 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  37.12 
 
 		 446 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  35.15 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  34.42 
 
 		 440 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  34.27 
 
 		 442 aa  222  8e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  32.86 
 
 		 442 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  34.72 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  32.03 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  37.84 
 
 		 473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  34.27 
 
 		 426 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  36.08 
 
 		 443 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  36.08 
 
 		 443 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  30.86 
 
 		 448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  32.87 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  35.15 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  33.94 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  32.32 
 
 		 436 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  31.11 
 
 		 426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 		 420 aa  212  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  33.73 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  33.96 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  36.34 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.64 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  32.87 
 
 		 464 aa  210  3e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  31.87 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  35.32 
 
 		 439 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 		 421 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  30.98 
 
 		 441 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  32 
 
 		 422 aa  207  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 422 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>