22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4755 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2005  hypothetical protein  92.18 
 
 		 408 aa  781    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375654  normal  0.0926262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4755  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  849    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.0689026 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  24.13 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  22.97 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  26.05 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  23.81 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  22.65 
 
 		 370 aa  53.9  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  25.5 
 
 		 728 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3031  amino acid adenylation domain protein  23.74 
 
 		 1466 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  24.92 
 
 		 728 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  23.74 
 
 		 1466 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  22.8 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  25.87 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  23.23 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  25.46 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  22.83 
 
 		 346 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  24.21 
 
 		 371 aa  47  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  25.08 
 
 		 689 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  23.9 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  23.41 
 
 		 340 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  23.41 
 
 		 340 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  23.18 
 
 		 710 aa  43.1  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>