More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0689 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  78.57 
 
 		 468 aa  652    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 447 aa  877    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  82.11 
 
 		 455 aa  706    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 447 aa  877    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 447 aa  877    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  81.36 
 
 		 456 aa  696    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  62.1 
 
 		 445 aa  513  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  59.47 
 
 		 457 aa  491  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  56.52 
 
 		 438 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  54.55 
 
 		 443 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  52.63 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  52.87 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  52.3 
 
 		 434 aa  382  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  48.87 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  49.77 
 
 		 448 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  50.35 
 
 		 455 aa  365  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  45.99 
 
 		 477 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  44.2 
 
 		 501 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  49.77 
 
 		 455 aa  342  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  45.52 
 
 		 473 aa  340  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  42.8 
 
 		 473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  49.66 
 
 		 440 aa  325  9e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  43.84 
 
 		 476 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  47.26 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  46.88 
 
 		 430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  45.52 
 
 		 456 aa  310  4e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  34.1 
 
 		 443 aa  263  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  34.27 
 
 		 464 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  35.08 
 
 		 454 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  38.11 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  37.53 
 
 		 446 aa  252  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  34.66 
 
 		 434 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  32.17 
 
 		 464 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  34.74 
 
 		 443 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  32.18 
 
 		 458 aa  242  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  33.8 
 
 		 443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  37.44 
 
 		 441 aa  239  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  29.47 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  31.69 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  32.49 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  31.69 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  29.29 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  28.83 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  29.29 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  29.29 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  29.29 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  29.29 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  29.29 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  28.83 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  29.52 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  36.64 
 
 		 458 aa  227  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  29.37 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  28.77 
 
 		 441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  32.86 
 
 		 421 aa  219  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 440 aa  219  7e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  31.34 
 
 		 428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.78 
 
 		 461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  31.4 
 
 		 428 aa  216  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  32.56 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  33.56 
 
 		 438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  30.95 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 		 428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 		 428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  35.68 
 
 		 440 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  32.18 
 
 		 436 aa  212  9e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  36.26 
 
 		 425 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  30.8 
 
 		 435 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  35.59 
 
 		 453 aa  210  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  31.63 
 
 		 442 aa  209  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  34.88 
 
 		 414 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  34.55 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  30.63 
 
 		 448 aa  206  6e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  31.15 
 
 		 448 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  31.15 
 
 		 448 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  30.86 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  30.75 
 
 		 438 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  34.34 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  35.31 
 
 		 473 aa  203  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  32.72 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  32.56 
 
 		 430 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  34.11 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  36.49 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  33.88 
 
 		 443 aa  200  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  29.77 
 
 		 450 aa  200  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  33.88 
 
 		 443 aa  200  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  31.86 
 
 		 420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  29.68 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  32.43 
 
 		 436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  29.45 
 
 		 436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  32.11 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  32.18 
 
 		 419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.8 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0896  glutamyl-tRNA reductase  30.68 
 
 		 429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.583722  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  35.57 
 
 		 408 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 		 432 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  34.91 
 
 		 422 aa  196  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  37.27 
 
 		 446 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>