283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0600 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0600  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  36.67 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  38.73 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  39.62 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  34.29 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  37.09 
 
 		 209 aa  98.6  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  35.76 
 
 		 210 aa  98.2  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  32.02 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 		 199 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  35.91 
 
 		 197 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  32.32 
 
 		 200 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  33.11 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 199 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  33.75 
 
 		 200 aa  92  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  33.75 
 
 		 200 aa  92  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  31.74 
 
 		 211 aa  91.7  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  29.73 
 
 		 208 aa  91.7  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  38.52 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 		 215 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  34.3 
 
 		 219 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  34.3 
 
 		 219 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  37.97 
 
 		 210 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  34.3 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  34 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  34.3 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  34.3 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  34.3 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  33.13 
 
 		 219 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  27.1 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  33.91 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  29.87 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  34.3 
 
 		 218 aa  89.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  38.13 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 		 205 aa  88.6  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 275 aa  89  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  33.57 
 
 		 287 aa  88.2  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  37.6 
 
 		 196 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  36.8 
 
 		 226 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  36.8 
 
 		 200 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  36.43 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  36.43 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  36.43 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  36.43 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  36.43 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  36.43 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  36.43 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  33.11 
 
 		 166 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  30.19 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  33.51 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  36.43 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  31.13 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  33.13 
 
 		 211 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  33.73 
 
 		 204 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  33.13 
 
 		 211 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0037  electron transport protein SCO1/SenC  37.59 
 
 		 214 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0273218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  33.13 
 
 		 211 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  29.67 
 
 		 199 aa  84.7  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  29.57 
 
 		 218 aa  84.7  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  31.93 
 
 		 226 aa  84.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  28.57 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  31.74 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  31.74 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  32.14 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  33.11 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  33.09 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  31.82 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  29.61 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  31.33 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0796  hypothetical protein  33.81 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  29.94 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  32 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  36.88 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  37.12 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  31.82 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  34.95 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  32.91 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  32.21 
 
 		 221 aa  80.9  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 215 aa  80.9  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  28.27 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  29.82 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  32.24 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0096  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000173101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  30.18 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  32.89 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
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NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  36.17 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
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NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  29.8 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  31.97 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  34.03 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
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NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  29.05 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  36.17 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  31.01 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
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