More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4139 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
245 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.37 
 
 
245 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0627503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.7 
 
 
254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0356148  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3998  ABC transporter, inner membrane subunit  79.1 
 
 
253 aa  322  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.28 
 
 
264 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0827  ABC aliphatic sulfonate transporter, inner membrane subunit  47.5 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.819281  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  42.92 
 
 
252 aa  204  9e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.15 
 
 
263 aa  194  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0998  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.37 
 
 
260 aa  181  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.944594 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
259 aa  176  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.31 
 
 
302 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.17 
 
 
321 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
291 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.8 
 
 
291 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.806375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.65 
 
 
320 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
294 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
345 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0917022  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
300 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
441 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0502009  hitchhiker  0.0000630788 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.93 
 
 
261 aa  141  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
319 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03033  transmembranee ABC transporter protein  37.29 
 
 
298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
308 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
289 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  34.87 
 
 
289 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30900  ABC transporter, permease protein  38.66 
 
 
288 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6691  putative ABC transporter  36.77 
 
 
288 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1900  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.93 
 
 
252 aa  131  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128113  hitchhiker  0.000000000000910228 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
259 aa  129  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.21 
 
 
266 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.95 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829949  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
292 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72654  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
255 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
288 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
252 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4890  putative ABC transporter (permease protein)  35.17 
 
 
281 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2837  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.24 
 
 
266 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.115716  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10010  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  42.18 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00312857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.52 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
277 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
263 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.66 
 
 
264 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
294 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.55 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3153  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.74 
 
 
303 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
303 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.451363  normal  0.0367857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5196  ABC transporter, permease protein  37.71 
 
 
288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.439861  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0339  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.71 
 
 
311 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0140  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.44 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620042  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475828  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.65 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
295 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
295 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
295 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
287 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.778332  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466577  normal  0.686195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
252 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
287 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.97734  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
288 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  34.51 
 
 
279 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  33.63 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
288 aa  108  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
296 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4139  sulfonate/nitrate ABC transporter permease  37.45 
 
 
292 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.241741  normal  0.999839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0538  putative ABC transporter (permease protein)  35.58 
 
 
287 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34790  putative permease of ABC transporter  38.57 
 
 
288 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120138  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
300 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.563541  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
301 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4966  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.22 
 
 
187 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2500  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 
268 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
295 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  36.44 
 
 
274 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0213  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
252 aa  106  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  32.88 
 
 
283 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  36.44 
 
 
274 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0340  permease  36.44 
 
 
313 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2036  permease  36.44 
 
 
323 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0821  permease  36.44 
 
 
313 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00555891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1881  ABC transporter, permease protein  36.44 
 
 
323 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1684  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, permease protein  36.44 
 
 
323 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483892  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
281 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.63 
 
 
275 aa  105  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1869  ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 
323 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2172  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  37.38 
 
 
292 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.287546  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2492  ABC aliphatic sulfonates transporter, innermembrane subunit  33.48 
 
 
280 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.773133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>