More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9278 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
291 aa  564  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.19 
 
 
291 aa  328  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.806375  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.51 
 
 
345 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0917022  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.96 
 
 
367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829949  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.04 
 
 
302 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.32 
 
 
319 aa  212  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.76 
 
 
441 aa  201  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0502009  hitchhiker  0.0000630788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.02 
 
 
300 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 
321 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0827  ABC aliphatic sulfonate transporter, inner membrane subunit  41.42 
 
 
252 aa  175  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.819281  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107512 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  38.75 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10010  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  42.01 
 
 
307 aa  162  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00312857  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
264 aa  158  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 
254 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0356148  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
259 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0627503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
245 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0998  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.3 
 
 
260 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.944594 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3998  ABC transporter, inner membrane subunit  39.5 
 
 
253 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72654  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
288 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30900  ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 
288 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.92 
 
 
279 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1900  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.16 
 
 
252 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128113  hitchhiker  0.000000000000910228 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
292 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.13 
 
 
261 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
295 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
295 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  33.63 
 
 
282 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
295 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.34 
 
 
282 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
295 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
295 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620042  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
282 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.39 
 
 
306 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32 
 
 
275 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  29.58 
 
 
289 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6691  putative ABC transporter  29.72 
 
 
288 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
292 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475828  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  31.44 
 
 
286 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
289 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
289 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
287 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466577  normal  0.686195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
277 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
255 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
287 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.778332  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.97734  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
287 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.75 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0156  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.21 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557075  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  29.88 
 
 
274 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 
252 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  29.92 
 
 
252 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
298 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
298 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  29.88 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
265 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
265 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
264 aa  95.9  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.71 
 
 
284 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.81 
 
 
286 aa  94.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973794  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  30.71 
 
 
262 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.27 
 
 
301 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  28.36 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  0.837307 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 
266 aa  94  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.92 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  30.71 
 
 
262 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.86 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
253 aa  94.7  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
270 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03033  transmembranee ABC transporter protein  29.19 
 
 
298 aa  94  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21600  aliphatic sulfonates ABC transporter, inner membrane component  28.7 
 
 
284 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
265 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4890  putative ABC transporter (permease protein)  30.45 
 
 
281 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.71 
 
 
264 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2172  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  30.77 
 
 
292 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.287546  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  29.71 
 
 
264 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 
254 aa  93.6  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.76 
 
 
286 aa  93.2  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113876 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  30.41 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
305 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
308 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.95 
 
 
259 aa  92.8  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4842  putative ABC transporter (permease protein)  32.74 
 
 
286 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7646  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  28.7 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0357497  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2837  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.93 
 
 
266 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.115716  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  29.65 
 
 
279 aa  92.4  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  34.15 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0140  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.23 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>