More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1412 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
277 aa  530  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72654  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0827  ABC aliphatic sulfonate transporter, inner membrane subunit  38.82 
 
 
252 aa  165  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.819281  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
345 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0917022  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  36.4 
 
 
252 aa  147  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
264 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
291 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.806375  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0356148  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
441 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0502009  hitchhiker  0.0000630788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
239 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0627503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
367 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829949  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
245 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  37.4 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  0.837307 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
300 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3998  ABC transporter, inner membrane subunit  40.74 
 
 
253 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.05 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0998  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.06 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.944594 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
264 aa  117  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
320 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.62 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
288 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.63 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7197  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  33.33 
 
 
272 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0116141  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
254 aa  110  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03033  transmembranee ABC transporter protein  32.03 
 
 
298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
301 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
298 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
298 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.21 
 
 
282 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
253 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  33.59 
 
 
282 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.79 
 
 
286 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.453695  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
288 aa  105  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.53875  normal  0.0146473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  34.63 
 
 
274 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.83 
 
 
266 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
285 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
267 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
259 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  34.63 
 
 
274 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
295 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
289 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
295 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
295 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.76 
 
 
301 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
282 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  32.32 
 
 
250 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.8 
 
 
261 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  30.47 
 
 
284 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.03 
 
 
266 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  30.47 
 
 
284 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  30.47 
 
 
284 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
292 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0620  taurine transport system permease protein TauC  28.74 
 
 
245 aa  100  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00071484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  29.78 
 
 
279 aa  99.4  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4842  putative ABC transporter (permease protein)  39.9 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1503  taurine ABC transporter, permease protein  30.47 
 
 
288 aa  99.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02450  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  36.36 
 
 
289 aa  99  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30900  ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 
288 aa  99.4  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
252 aa  98.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6691  putative ABC transporter  32.66 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  34.17 
 
 
320 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  33.76 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.21 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.78 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.936191 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.08 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  33.62 
 
 
283 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.78 
 
 
284 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1323  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.95 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0560082 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
295 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620042  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
295 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
288 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
321 aa  95.5  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1869  ABC transporter, permease protein  36.02 
 
 
323 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
256 aa  95.5  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10010  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  36.84 
 
 
307 aa  94.7  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00312857  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  27.6 
 
 
289 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  31.09 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
275 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  31.09 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  26.29 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2036  permease  35.55 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  31.09 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0233  ABC transporter, permease protein  31.44 
 
 
241 aa  94  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1881  ABC transporter, permease protein  35.55 
 
 
323 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259597  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475828  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1684  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, permease protein  35.55 
 
 
323 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>