More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1232 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
319 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.48 
 
 
302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.45 
 
 
300 aa  299  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.17 
 
 
441 aa  275  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0502009  hitchhiker  0.0000630788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.41 
 
 
294 aa  275  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.72 
 
 
321 aa  249  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
320 aa  248  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.32 
 
 
291 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
263 aa  185  9e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10010  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  45 
 
 
307 aa  185  9e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00312857  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0827  ABC aliphatic sulfonate transporter, inner membrane subunit  40.23 
 
 
252 aa  179  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.819281  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
345 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0917022  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
291 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.806375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829949  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 
259 aa  159  6e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  36.08 
 
 
252 aa  155  6e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 
254 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0356148  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
264 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0998  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.8 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.944594 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0627503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
284 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
255 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3998  ABC transporter, inner membrane subunit  36.73 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2358  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  29.88 
 
 
269 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
308 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.27 
 
 
306 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
292 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475828  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30900  ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 
288 aa  105  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
277 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72654  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
305 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  27.27 
 
 
289 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30.52 
 
 
293 aa  102  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  0.837307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.51 
 
 
282 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.92 
 
 
289 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_003296  RS03033  transmembranee ABC transporter protein  29.95 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  34.69 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
292 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367955 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.49 
 
 
275 aa  99  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6691  putative ABC transporter  29.45 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.56 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.97734  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.64 
 
 
279 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.49 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0140  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.6 
 
 
288 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.54 
 
 
261 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620042  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  33.46 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 
261 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2837  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.9 
 
 
266 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.115716  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2172  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  32.19 
 
 
292 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.287546  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
279 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5196  ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.3 
 
 
292 aa  93.6  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
275 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.59 
 
 
279 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  31.55 
 
 
252 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  33.46 
 
 
274 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0339  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.43 
 
 
311 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
269 aa  92.8  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 
253 aa  92.8  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
259 aa  92.8  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
294 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
287 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.778332  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
287 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466577  normal  0.686195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
292 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.89 
 
 
331 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0156  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.14 
 
 
292 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557075  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4139  sulfonate/nitrate ABC transporter permease  33.61 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.241741  normal  0.999839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
288 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0538  putative ABC transporter (permease protein)  29.96 
 
 
287 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4890  putative ABC transporter (permease protein)  33.72 
 
 
281 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.34 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  30.67 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.23 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  29.51 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
319 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.23 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
286 aa  90.9  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
292 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
252 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
254 aa  90.1  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.83 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>