More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4373 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
308 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6691  putative ABC transporter  71.63 
 
 
288 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03033  transmembranee ABC transporter protein  68.6 
 
 
298 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  70.94 
 
 
289 aa  381  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.06 
 
 
298 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.57 
 
 
289 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.53 
 
 
292 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.06 
 
 
298 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.93 
 
 
292 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0538  putative ABC transporter (permease protein)  70.82 
 
 
287 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.43 
 
 
303 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.451363  normal  0.0367857 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3153  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  70.1 
 
 
303 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.42 
 
 
292 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475828  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30900  ABC transporter, permease protein  62.26 
 
 
288 aa  328  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.08 
 
 
295 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.08 
 
 
295 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.66 
 
 
287 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.778332  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.28 
 
 
287 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.44 
 
 
292 aa  316  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.28 
 
 
295 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.91 
 
 
287 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466577  normal  0.686195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.28 
 
 
287 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.97734  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0140  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  64.53 
 
 
288 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.7 
 
 
295 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620042  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0339  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.39 
 
 
311 aa  311  9e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2172  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  59.79 
 
 
292 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.287546  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0156  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  59.93 
 
 
292 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557075  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4139  sulfonate/nitrate ABC transporter permease  66.03 
 
 
292 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.241741  normal  0.999839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5196  ABC transporter, permease protein  60.14 
 
 
288 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.71 
 
 
295 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.94 
 
 
288 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.14 
 
 
300 aa  295  8e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.563541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.84 
 
 
288 aa  295  9e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.49 
 
 
288 aa  292  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.439861  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  57.8 
 
 
294 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34790  putative permease of ABC transporter  63.77 
 
 
288 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120138  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.86 
 
 
270 aa  282  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.95 
 
 
290 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1881  ABC transporter, permease protein  60.7 
 
 
323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1869  ABC transporter, permease protein  60.7 
 
 
323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1684  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, permease protein  60.7 
 
 
323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483892  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0821  permease  60.7 
 
 
313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00555891  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0340  permease  60.7 
 
 
313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2036  permease  60.7 
 
 
323 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  59.31 
 
 
578 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.78 
 
 
295 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.15 
 
 
288 aa  265  8e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4890  putative ABC transporter (permease protein)  53.09 
 
 
281 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.89 
 
 
296 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4966  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  72 
 
 
187 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04668  permease  59.52 
 
 
239 aa  215  8e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  33.04 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0827  ABC aliphatic sulfonate transporter, inner membrane subunit  34.23 
 
 
252 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.819281  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
245 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0627503  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
263 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
254 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0356148  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.09 
 
 
263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  33.79 
 
 
283 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
319 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
278 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
377 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.07 
 
 
266 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.23 
 
 
300 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
273 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  32.46 
 
 
273 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3998  ABC transporter, inner membrane subunit  34.8 
 
 
253 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  30.58 
 
 
252 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
267 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  31.84 
 
 
272 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
321 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.76 
 
 
259 aa  101  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 
294 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
270 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
250 aa  99.4  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
273 aa  99.4  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
264 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  31.98 
 
 
272 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.16 
 
 
441 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0502009  hitchhiker  0.0000630788 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0377  hypothetical protein  29.27 
 
 
253 aa  98.6  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.58 
 
 
277 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  31.11 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0213  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
252 aa  96.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
320 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107512 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.33 
 
 
261 aa  96.3  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  31.82 
 
 
272 aa  95.9  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  31.82 
 
 
272 aa  95.9  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.31 
 
 
253 aa  95.9  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4841  ABC transporter permease  33.19 
 
 
260 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>