More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1295 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
259 aa  508  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.86 
 
 
263 aa  340  1e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0827  ABC aliphatic sulfonate transporter, inner membrane subunit  41.83 
 
 
252 aa  208  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.819281  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
264 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  41.35 
 
 
252 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
254 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0356148  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
245 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0627503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
245 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
319 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
302 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3998  ABC transporter, inner membrane subunit  38.82 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0998  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.98 
 
 
260 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.944594 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
321 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
291 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.806375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.35 
 
 
320 aa  155  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.71 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
291 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
441 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0502009  hitchhiker  0.0000630788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
294 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
345 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0917022  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10010  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  43.12 
 
 
307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00312857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.94 
 
 
266 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
367 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829949  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  29.02 
 
 
289 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
288 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30900  ABC transporter, permease protein  29.88 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6691  putative ABC transporter  28.4 
 
 
288 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.69 
 
 
289 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_003296  RS03033  transmembranee ABC transporter protein  28.89 
 
 
298 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
295 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475828  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.71 
 
 
308 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0538  putative ABC transporter (permease protein)  30.68 
 
 
287 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
295 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620042  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  32.74 
 
 
252 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
253 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
295 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
295 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
295 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
277 aa  106  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72654  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2172  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  28 
 
 
292 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.287546  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.56 
 
 
298 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.56 
 
 
298 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.91 
 
 
284 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
295 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0156  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  30.14 
 
 
292 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557075  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
263 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
260 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
254 aa  102  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.71 
 
 
292 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0140  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.65 
 
 
288 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.71 
 
 
252 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4890  putative ABC transporter (permease protein)  30.36 
 
 
281 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  32.11 
 
 
298 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
287 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.97734  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 
305 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  26.48 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.58 
 
 
261 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.62 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3153  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  28.16 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  28.76 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7197  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  28.99 
 
 
272 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0116141  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.16 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.451363  normal  0.0367857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
265 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.36 
 
 
306 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.75 
 
 
292 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
253 aa  95.9  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34790  putative permease of ABC transporter  30.97 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120138  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.02 
 
 
261 aa  95.9  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.73 
 
 
252 aa  95.5  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.22 
 
 
296 aa  95.1  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4966  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.9 
 
 
187 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 
287 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466577  normal  0.686195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.29 
 
 
280 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4139  sulfonate/nitrate ABC transporter permease  31.75 
 
 
292 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.241741  normal  0.999839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
287 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
287 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.778332  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
239 aa  92.8  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.79 
 
 
273 aa  92.4  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.54 
 
 
291 aa  92.4  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.74 
 
 
264 aa  92  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2036  permease  28.44 
 
 
323 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.34 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1684  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, permease protein  28.44 
 
 
323 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0340  permease  28.44 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1881  ABC transporter, permease protein  28.44 
 
 
323 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0821  permease  28.44 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00555891  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 
300 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.563541  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.53 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1869  ABC transporter, permease protein  28.44 
 
 
323 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>