More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4890 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4890  putative ABC transporter (permease protein)  100 
 
 		 281 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30900  ABC transporter, permease protein  61.51 
 
 		 288 aa  323  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.86 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.83 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.04 
 
 		 292 aa  288  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.96 
 
 		 295 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.6 
 
 		 287 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.96 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.96 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.6 
 
 		 287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.778332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.99 
 
 		 287 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466577  normal  0.686195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5196  ABC transporter, permease protein  63.6 
 
 		 288 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0339  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  63.6 
 
 		 311 aa  284  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.99 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.97734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.99 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.32 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0140  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  61.81 
 
 		 288 aa  278  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.43 
 
 		 298 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.43 
 
 		 298 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2172  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  59.6 
 
 		 292 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.287546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0156  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  58.8 
 
 		 292 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.99 
 
 		 300 aa  272  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.563541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6691  putative ABC transporter  52.73 
 
 		 288 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03033  transmembranee ABC transporter protein  55.27 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0821  permease  57.85 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00555891  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.09 
 
 		 308 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1881  ABC transporter, permease protein  57.85 
 
 		 323 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1869  ABC transporter, permease protein  57.85 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4139  sulfonate/nitrate ABC transporter permease  57.14 
 
 		 292 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.241741  normal  0.999839 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1684  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, permease protein  57.85 
 
 		 323 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0340  permease  57.85 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2036  permease  57.85 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  55.2 
 
 		 289 aa  265  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0538  putative ABC transporter (permease protein)  54.55 
 
 		 287 aa  265  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.8 
 
 		 288 aa  265  8e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.439861  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.4 
 
 		 288 aa  264  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60 
 
 		 290 aa  262  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34790  putative permease of ABC transporter  64.35 
 
 		 288 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120138  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.54 
 
 		 288 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.18 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  56.36 
 
 		 578 aa  255  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.25 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.91 
 
 		 294 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3153  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  53.57 
 
 		 303 aa  248  7e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.57 
 
 		 303 aa  248  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.451363  normal  0.0367857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.08 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4966  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  74.83 
 
 		 187 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.74 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.98 
 
 		 270 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04668  permease  60.39 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0827  ABC aliphatic sulfonate transporter, inner membrane subunit  31.85 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.819281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0356148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0627503  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  33.47 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  33.47 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  33.47 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.54 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3998  ABC transporter, inner membrane subunit  36.82 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  33.61 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  32.96 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  30.67 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1129  taurine transport system permease protein TauC  33.86 
 
 		 241 aa  107  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.774255  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 279 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  33.19 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  34.09 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  33.71 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  33.71 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  33.71 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  33.71 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  33.71 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0233  ABC transporter, permease protein  32.6 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.78 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.35 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  34.53 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  30.85 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  30.85 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  33.33 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  30.85 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  30.85 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  30.85 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  30.85 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.81 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.36 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.2 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>