More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0140 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0140  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 		 288 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.21 
 
 		 287 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30900  ABC transporter, permease protein  79.17 
 
 		 288 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.21 
 
 		 287 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.778332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5196  ABC transporter, permease protein  83.33 
 
 		 288 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0339  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  83.33 
 
 		 311 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.86 
 
 		 287 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466577  normal  0.686195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.86 
 
 		 287 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.97734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34790  putative permease of ABC transporter  82.64 
 
 		 288 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120138  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4139  sulfonate/nitrate ABC transporter permease  73.87 
 
 		 292 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.241741  normal  0.999839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.3 
 
 		 300 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.563541  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.44 
 
 		 292 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.55 
 
 		 292 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0156  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  71.28 
 
 		 292 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.6 
 
 		 295 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2172  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  69.15 
 
 		 292 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.287546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.96 
 
 		 295 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.96 
 
 		 295 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.34 
 
 		 290 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.92 
 
 		 288 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.22 
 
 		 288 aa  362  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.439861  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.12 
 
 		 295 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.63 
 
 		 295 aa  355  5e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  69.5 
 
 		 578 aa  341  9e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.53 
 
 		 308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6691  putative ABC transporter  58.68 
 
 		 288 aa  335  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.92 
 
 		 298 aa  329  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.92 
 
 		 298 aa  329  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  60.67 
 
 		 289 aa  327  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.05 
 
 		 289 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.71 
 
 		 288 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03033  transmembranee ABC transporter protein  63.02 
 
 		 298 aa  324  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.63 
 
 		 292 aa  322  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.92 
 
 		 292 aa  315  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1869  ABC transporter, permease protein  67.7 
 
 		 323 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1881  ABC transporter, permease protein  67.7 
 
 		 323 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1684  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, permease protein  67.7 
 
 		 323 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483892  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0821  permease  67.7 
 
 		 313 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00555891  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0340  permease  67.7 
 
 		 313 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2036  permease  67.7 
 
 		 323 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  61.92 
 
 		 294 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3153  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  59.86 
 
 		 303 aa  300  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.21 
 
 		 303 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.451363  normal  0.0367857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.45 
 
 		 288 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0538  putative ABC transporter (permease protein)  59.11 
 
 		 287 aa  298  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4890  putative ABC transporter (permease protein)  62.8 
 
 		 281 aa  291  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04668  permease  66.67 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4966  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  83.44 
 
 		 187 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.13 
 
 		 295 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.63 
 
 		 270 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0827  ABC aliphatic sulfonate transporter, inner membrane subunit  33.88 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.819281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3998  ABC transporter, inner membrane subunit  36.14 
 
 		 253 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  34.51 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0627503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.46 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 		 263 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 		 254 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0356148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 		 273 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  36.18 
 
 		 273 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  32.61 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 		 264 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  32.66 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  30.22 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 		 302 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 		 319 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.89 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.39 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.05 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  30 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  30 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  30 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  32.24 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.15 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0377  hypothetical protein  30.19 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 		 264 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2492  ABC aliphatic sulfonates transporter, innermembrane subunit  30.24 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.773133 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0233  ABC transporter, permease protein  31.53 
 
 		 241 aa  99.8  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 		 345 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0917022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.62 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 		 280 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>