More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7382 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
294 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.93 
 
 
441 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0502009  hitchhiker  0.0000630788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.41 
 
 
319 aa  275  8e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.53 
 
 
302 aa  256  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.47 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.91 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.58 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
291 aa  188  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 
367 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829949  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.806375  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
345 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0917022  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10010  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  40.64 
 
 
307 aa  168  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00312857  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0827  ABC aliphatic sulfonate transporter, inner membrane subunit  37.76 
 
 
252 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.819281  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  37.08 
 
 
252 aa  158  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
254 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0356148  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
245 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0627503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
245 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
259 aa  138  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0998  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.18 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.944594 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
264 aa  135  9e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3998  ABC transporter, inner membrane subunit  40.44 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
277 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72654  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
284 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6691  putative ABC transporter  28.2 
 
 
288 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
377 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
255 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  26.96 
 
 
289 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
292 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475828  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 
288 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.25 
 
 
279 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 
308 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30900  ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 
288 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.71 
 
 
289 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
252 aa  99.4  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.3 
 
 
306 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  30.42 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  30 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.25 
 
 
331 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
292 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
292 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.54 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
292 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.38 
 
 
277 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.38 
 
 
277 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
270 aa  95.5  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  28.06 
 
 
252 aa  95.5  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  26.4 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1900  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.67 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128113  hitchhiker  0.000000000000910228 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
303 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.451363  normal  0.0367857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42556  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.75 
 
 
252 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03033  transmembranee ABC transporter protein  28.83 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3153  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  28.17 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0666  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.27 
 
 
311 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0569164  decreased coverage  0.0039857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  28.46 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
295 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.03 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
295 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.06 
 
 
295 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620042  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.44 
 
 
310 aa  93.6  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.44 
 
 
294 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4890  putative ABC transporter (permease protein)  27.48 
 
 
281 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
290 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.42 
 
 
275 aa  92.8  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
305 aa  92  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 
295 aa  92.4  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  28.08 
 
 
312 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.79 
 
 
275 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
285 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.2 
 
 
279 aa  92  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  32 
 
 
578 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.44 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.44 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  27.17 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.96 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2172  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  29.88 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.287546  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7646  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  28.32 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0357497  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
286 aa  90.9  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113876 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0156  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  29.3 
 
 
292 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557075  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  29.58 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.86 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
286 aa  89.7  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973794  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.81 
 
 
286 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.703431 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.87 
 
 
314 aa  89  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.82677  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  25.79 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  26.37 
 
 
299 aa  87.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.67 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  27.46 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.71 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.86 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.27 
 
 
301 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.75 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0787698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>