More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4302 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
441 aa  849    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0502009  hitchhiker  0.0000630788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.93 
 
 
294 aa  445  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.71 
 
 
319 aa  277  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.5 
 
 
302 aa  273  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
300 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.53 
 
 
321 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.85 
 
 
320 aa  203  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
291 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
345 aa  179  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0917022  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
291 aa  176  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.806375  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0827  ABC aliphatic sulfonate transporter, inner membrane subunit  38.75 
 
 
252 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.819281  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10010  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  41.88 
 
 
307 aa  168  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00312857  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829949  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  36.67 
 
 
252 aa  159  8e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
263 aa  151  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
254 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0356148  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
259 aa  140  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0998  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.73 
 
 
260 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.944594 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
245 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0627503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
245 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.98 
 
 
264 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3998  ABC transporter, inner membrane subunit  39.72 
 
 
253 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
276 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
277 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72654  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6691  putative ABC transporter  32.14 
 
 
288 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
284 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
377 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
292 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475828  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
261 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.33 
 
 
279 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.17 
 
 
279 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  27.27 
 
 
289 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
255 aa  100  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 
298 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 
298 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.66 
 
 
289 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  32.08 
 
 
274 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  32.5 
 
 
274 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.16 
 
 
308 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
295 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.51 
 
 
277 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.31 
 
 
331 aa  98.2  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.51 
 
 
277 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
295 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30900  ABC transporter, permease protein  34.95 
 
 
288 aa  97.8  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
295 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_003296  RS03033  transmembranee ABC transporter protein  28.83 
 
 
298 aa  96.7  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.48 
 
 
288 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
286 aa  96.3  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
252 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
292 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.79 
 
 
310 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.07 
 
 
306 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 
296 aa  94.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  32.19 
 
 
278 aa  94.4  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  32.74 
 
 
578 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
295 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620042  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0156  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  30.8 
 
 
292 aa  94  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557075  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2172  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  30.29 
 
 
292 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.287546  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.1 
 
 
292 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.36 
 
 
282 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.59 
 
 
292 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1900  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.35 
 
 
252 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128113  hitchhiker  0.000000000000910228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  31.36 
 
 
252 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
276 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.936191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  29.03 
 
 
279 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
280 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7646  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 
282 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0357497  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  27.7 
 
 
311 aa  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.8 
 
 
295 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3153  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.18 
 
 
303 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
319 aa  91.3  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
303 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.451363  normal  0.0367857 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.47 
 
 
252 aa  90.5  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
270 aa  90.5  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
285 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 
282 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  28.35 
 
 
312 aa  90.1  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.8 
 
 
261 aa  90.1  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.29 
 
 
291 aa  90.1  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 
305 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
290 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.5 
 
 
295 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
295 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
239 aa  89  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2555  nitrate transport permease  28.77 
 
 
314 aa  88.6  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
286 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.703431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.53875  normal  0.0146473 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4966  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.78 
 
 
187 aa  88.2  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.05 
 
 
275 aa  87.8  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.3 
 
 
266 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 
252 aa  88.2  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
263 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.79 
 
 
275 aa  87.8  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.8 
 
 
280 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0666  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  27.94 
 
 
311 aa  87.4  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0569164  decreased coverage  0.0039857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0538  putative ABC transporter (permease protein)  30.72 
 
 
287 aa  87  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02450  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  31.67 
 
 
289 aa  86.7  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458789  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  28 
 
 
299 aa  86.7  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 
289 aa  86.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>