74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0458 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  445  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  97.16 
 
 
212 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  39.9 
 
 
203 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  37.31 
 
 
212 aa  141  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  37.06 
 
 
205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  37.37 
 
 
220 aa  139  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  37.1 
 
 
197 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  35.53 
 
 
207 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  35.86 
 
 
200 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  34.65 
 
 
199 aa  135  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  36.41 
 
 
251 aa  134  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  36.92 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  42.59 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  41.14 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  37.63 
 
 
212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  33.16 
 
 
244 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  34.72 
 
 
224 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  33.5 
 
 
223 aa  122  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  33.33 
 
 
207 aa  122  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  39.2 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  32.14 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  32.12 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  39.49 
 
 
217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  35.53 
 
 
217 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  33.5 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  35.2 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  33.5 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.63 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.63 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  33.67 
 
 
233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  32.14 
 
 
207 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  35.71 
 
 
215 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  32.14 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  35.29 
 
 
209 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  31.63 
 
 
207 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  38.22 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  34.48 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  34.52 
 
 
209 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  34.31 
 
 
213 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  34 
 
 
210 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  34.02 
 
 
245 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  35.33 
 
 
230 aa  111  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  35.57 
 
 
230 aa  111  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  34.2 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  33.66 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  35.71 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  35.16 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  37.5 
 
 
227 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  32.99 
 
 
220 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  34.76 
 
 
211 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  30.89 
 
 
304 aa  98.2  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  32.04 
 
 
252 aa  95.1  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  31.35 
 
 
252 aa  94.7  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  28.57 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  40.24 
 
 
126 aa  62  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3733.1  proline hydroxylase  35.79 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1651  hypothetical protein  42.65 
 
 
268 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  25.7 
 
 
291 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0923  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  35.16 
 
 
238 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0949  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  35.16 
 
 
237 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3466  2OG-Fe(II) oxygenase  29.11 
 
 
306 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.413684  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0957  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  35.16 
 
 
238 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  23.53 
 
 
324 aa  53.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2659  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.15 
 
 
299 aa  52.4  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00638484  decreased coverage  0.00126979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2554  2OG-Fe(II) oxygenase  32.97 
 
 
247 aa  52  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2480  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  31.06 
 
 
300 aa  50.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.019488  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26319  predicted protein  23.61 
 
 
323 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45723  predicted protein  22.69 
 
 
541 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2404  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  25 
 
 
457 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1127  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  26.32 
 
 
303 aa  45.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.328998  decreased coverage  0.000557231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5157  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  28.45 
 
 
309 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.838814  normal  0.639881 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2547  proline hydroxylase-like protein  30.84 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1635  hypothetical protein  33.85 
 
 
299 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3024  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  26.55 
 
 
208 aa  42  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>