60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0643 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 304 aa  624  1e-178  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  55.31 
 
 		 252 aa  311  7.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  68.32 
 
 		 252 aa  304  9.000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  37.82 
 
 		 223 aa  116  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  34.93 
 
 		 219 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  35.79 
 
 		 207 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  35.79 
 
 		 207 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  35.45 
 
 		 199 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  35.26 
 
 		 207 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  37.24 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  35.14 
 
 		 207 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  35.26 
 
 		 199 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  35.26 
 
 		 199 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.74 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  35.26 
 
 		 207 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  34.02 
 
 		 214 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  35.26 
 
 		 199 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  41.61 
 
 		 215 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  37.04 
 
 		 205 aa  99.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  33.68 
 
 		 207 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  30.89 
 
 		 212 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  33.85 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  31.41 
 
 		 212 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  33.68 
 
 		 207 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  32.28 
 
 		 224 aa  97.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  39.42 
 
 		 245 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  36.26 
 
 		 210 aa  95.1  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  40.88 
 
 		 217 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  39.04 
 
 		 227 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  31.72 
 
 		 197 aa  94  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  32.32 
 
 		 220 aa  94  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  34.36 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  33.83 
 
 		 226 aa  93.6  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  37.76 
 
 		 217 aa  92.8  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  41.55 
 
 		 211 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  40.15 
 
 		 210 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  40.85 
 
 		 211 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  29.03 
 
 		 200 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  40.85 
 
 		 207 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  31.47 
 
 		 203 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  32.65 
 
 		 230 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  38.69 
 
 		 213 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  35.04 
 
 		 244 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  35.71 
 
 		 225 aa  87  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  32 
 
 		 212 aa  86.3  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  33.33 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  36.5 
 
 		 233 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  31.77 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  29.9 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  31.75 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  33.1 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  28.28 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  38.54 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45723  predicted protein  22.47 
 
 		 541 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136457  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  34.95 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  32.61 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  29.27 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  35.53 
 
 		 126 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1813  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.33 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>