15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3024 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3024  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  100 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5157  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  28.04 
 
 		 309 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.838814  normal  0.639881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1127  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  27.36 
 
 		 303 aa  85.9  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.328998  decreased coverage  0.000557231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3466  2OG-Fe(II) oxygenase  29.15 
 
 		 306 aa  84.7  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.413684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2480  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  39.47 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.019488  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2404  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  29.02 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2659  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  27.42 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00638484  decreased coverage  0.00126979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  31.76 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  26.02 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  36.46 
 
 		 338 aa  45.1  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  28.65 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  24.03 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  29.25 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  25.52 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  26.55 
 
 		 212 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>