64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2920 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  54.46 
 
 		 227 aa  238  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  54.85 
 
 		 210 aa  234  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  54.72 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  49.77 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  50.25 
 
 		 217 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  47.91 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  45.27 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  46.73 
 
 		 220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  42.72 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  44.95 
 
 		 199 aa  177  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  42.52 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  44.28 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  49.4 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  43 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  43.43 
 
 		 199 aa  167  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  43.43 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  40 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  43.43 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  41.5 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  40.7 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  43 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  42.92 
 
 		 207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  42.5 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  43 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  43 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  46.54 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  45.45 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  44.72 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  44.72 
 
 		 197 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  40.89 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  42.86 
 
 		 210 aa  148  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  40.89 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  40.43 
 
 		 244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  41.41 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  41.41 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  42.49 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  37.2 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  38.86 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  39.9 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  39.8 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  43.9 
 
 		 205 aa  138  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  39.02 
 
 		 210 aa  137  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  38.65 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  42.29 
 
 		 251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  37.04 
 
 		 203 aa  127  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  37.24 
 
 		 212 aa  118  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  35.71 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  34.64 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  36.09 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  41.61 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  39.55 
 
 		 252 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  39.85 
 
 		 252 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  29.56 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  42.47 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  33.59 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  33.73 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  32.53 
 
 		 324 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26414  predicted protein  32.47 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0496773  normal  0.028016 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3077  hypothetical protein  43.08 
 
 		 273 aa  45.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3876  hypothetical protein  34.31 
 
 		 309 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.31832  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2554  2OG-Fe(II) oxygenase  30.69 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3024  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  25.52 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1210  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  32.69 
 
 		 248 aa  42  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>