70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0453 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 217 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  55.67 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  57 
 
 		 227 aa  234  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  54.4 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  53.37 
 
 		 223 aa  221  6e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  50.25 
 
 		 215 aa  211  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  46.28 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  42.71 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  44.33 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  43.23 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  42.29 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  41.97 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  40.93 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  45.5 
 
 		 197 aa  161  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  41.97 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  42.19 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  42.49 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  41.97 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  42.49 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  42.49 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  42.19 
 
 		 199 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  42.19 
 
 		 199 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  42.49 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  42.19 
 
 		 199 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  39.18 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  38.92 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  52.26 
 
 		 200 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  40.41 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  42.86 
 
 		 209 aa  154  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  44.85 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  38.65 
 
 		 230 aa  147  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  39.9 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  37.44 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  38.97 
 
 		 245 aa  138  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  38.61 
 
 		 219 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  40 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  40.8 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  40.89 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  39.2 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  37.31 
 
 		 203 aa  131  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  37.31 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  38.19 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  38.19 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  36.68 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  40.46 
 
 		 251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  38.19 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  40.13 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  39.49 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  31.63 
 
 		 196 aa  114  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  34.85 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  40.88 
 
 		 304 aa  94.7  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  33.5 
 
 		 252 aa  89  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  36.96 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  29.33 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  40.74 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  36.47 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  26.11 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26414  predicted protein  26.54 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0496773  normal  0.028016 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  33.72 
 
 		 338 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1127  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  28.81 
 
 		 303 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.328998  decreased coverage  0.000557231 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2554  2OG-Fe(II) oxygenase  28.16 
 
 		 247 aa  48.5  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3876  hypothetical protein  38.89 
 
 		 309 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.31832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3024  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  26.02 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5157  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  26.96 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.838814  normal  0.639881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0640  hypothetical protein  36.49 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3313  hypothetical protein  29 
 
 		 273 aa  42.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106012  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44522  predicted protein  33.33 
 
 		 352 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.431246  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3077  hypothetical protein  29 
 
 		 273 aa  42  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3466  2OG-Fe(II) oxygenase  26.55 
 
 		 306 aa  41.6  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.413684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1635  hypothetical protein  39.53 
 
 		 299 aa  41.6  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>