58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0963 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 224 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  61.35 
 
 		 207 aa  278  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  61.35 
 
 		 207 aa  275  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  61.35 
 
 		 207 aa  274  9e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  60.39 
 
 		 207 aa  272  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  59.9 
 
 		 207 aa  268  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  59.9 
 
 		 207 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  58.45 
 
 		 207 aa  258  7e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  58.79 
 
 		 199 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  58.79 
 
 		 199 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  58.79 
 
 		 199 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  59.8 
 
 		 199 aa  252  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  54.59 
 
 		 207 aa  241  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  45.19 
 
 		 214 aa  195  6e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  43.84 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  47.37 
 
 		 197 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  45.08 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  41.18 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  41.38 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  40.27 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  46.15 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  40 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  42.71 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  41.41 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  38.35 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  48.7 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  39 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  41.97 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  38.92 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  40.74 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  41.27 
 
 		 210 aa  141  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  38.61 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  38.46 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  38.81 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  40 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  40.21 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  39.18 
 
 		 209 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  36.73 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  38.97 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  39.74 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  37.89 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  37.17 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  37.44 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  35.23 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  37.44 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  38.46 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  34.72 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  35.71 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  32.32 
 
 		 196 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  29.7 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  32.28 
 
 		 304 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  30.37 
 
 		 252 aa  89.4  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  28.8 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  29.06 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  40.85 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  28.77 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  33.33 
 
 		 338 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3876  hypothetical protein  36.92 
 
 		 309 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.31832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>