61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46896 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  100 
 
 
321 aa  658    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  37.31 
 
 
219 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  34.32 
 
 
251 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  29.9 
 
 
212 aa  95.9  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  30.57 
 
 
210 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  33.99 
 
 
199 aa  90.1  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  32.04 
 
 
209 aa  86.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  31.61 
 
 
211 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  28.77 
 
 
210 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  30.24 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  30.14 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  28.7 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  30.05 
 
 
245 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  32.45 
 
 
230 aa  84  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  32.32 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  29.9 
 
 
207 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  36.51 
 
 
196 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  29.95 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  32.66 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  30.2 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.29 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  31.09 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  30.2 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  30.2 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  29.86 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  30.2 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  30.2 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  29.27 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  29.86 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  30.73 
 
 
220 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  30.05 
 
 
232 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  31.94 
 
 
223 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  29.27 
 
 
211 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  36.89 
 
 
225 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  29.56 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  29.8 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  29.06 
 
 
207 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  30.22 
 
 
205 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  29.06 
 
 
207 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  28.08 
 
 
217 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  26.79 
 
 
200 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  29.06 
 
 
224 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  35.92 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  32.14 
 
 
214 aa  75.1  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  29.06 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  28.71 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  30.27 
 
 
211 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  34.43 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  35.71 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  38.46 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  29.06 
 
 
212 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  28.57 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  34.95 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  38.46 
 
 
126 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45723  predicted protein  33.57 
 
 
541 aa  52.8  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136457  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49288  oxidoreductase  26.98 
 
 
415 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48235  predicted protein  22.73 
 
 
326 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.652945  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  30.19 
 
 
252 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  30.19 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3077  hypothetical protein  35.9 
 
 
273 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3313  hypothetical protein  32.47 
 
 
273 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>