62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2041 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 207 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  72.36 
 
 		 199 aa  299  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  65.7 
 
 		 207 aa  295  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  66.67 
 
 		 207 aa  295  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  67.15 
 
 		 207 aa  294  6e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  66.18 
 
 		 207 aa  292  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  66.67 
 
 		 207 aa  291  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  65.7 
 
 		 207 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  65.33 
 
 		 199 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  65.33 
 
 		 199 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  65.33 
 
 		 199 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  60.87 
 
 		 207 aa  262  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  58.45 
 
 		 224 aa  258  6e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  46.19 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  45.81 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  45.1 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  46.39 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  45.54 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  39.41 
 
 		 220 aa  171  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  44.68 
 
 		 197 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  44.04 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  42.31 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  41.46 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  42.21 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  42.92 
 
 		 215 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  37.73 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  40.61 
 
 		 230 aa  163  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  40.93 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  39.81 
 
 		 225 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  42.57 
 
 		 244 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  39.11 
 
 		 209 aa  141  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  37.24 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  43.42 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  41.29 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  40.93 
 
 		 209 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  41.45 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  38.07 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  38.34 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  39.8 
 
 		 210 aa  131  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  36.9 
 
 		 251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  34.36 
 
 		 219 aa  124  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  33.51 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  37 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  37.31 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  36.82 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  32.12 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  36.82 
 
 		 211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  34 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  29.56 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  31.31 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  33.68 
 
 		 304 aa  99  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  34.03 
 
 		 252 aa  92.8  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  31.94 
 
 		 252 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  29.9 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  35.48 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  34.52 
 
 		 338 aa  51.6  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  38.24 
 
 		 126 aa  51.2  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3733.1  proline hydroxylase  35.87 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0957  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  34.78 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0949  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  34.78 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0923  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  34.78 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2554  2OG-Fe(II) oxygenase  31.18 
 
 		 247 aa  41.2  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>