61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02535 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  416  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  87.24 
 
 		 197 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  63.5 
 
 		 205 aa  281  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  45.08 
 
 		 224 aa  175  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  44.56 
 
 		 207 aa  174  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  44.04 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  44.56 
 
 		 207 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  44.04 
 
 		 207 aa  168  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  43.75 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  43.52 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  43.52 
 
 		 199 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  43.52 
 
 		 199 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  43.52 
 
 		 199 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  46.31 
 
 		 230 aa  167  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  43.52 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  43.3 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  43.52 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  42.71 
 
 		 223 aa  160  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  46.78 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  40.31 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  52.26 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  41.45 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  42.86 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  43.65 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  44.72 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  39.11 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  38.35 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  42.78 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  39.79 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  43.03 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  45.39 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  35.86 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  35.86 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  39.29 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  35.23 
 
 		 244 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  37.11 
 
 		 245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  35.2 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  37.44 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  37.44 
 
 		 211 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  37.95 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  37.81 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  37.25 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  33.85 
 
 		 232 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  36.27 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  34.72 
 
 		 209 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  35.23 
 
 		 233 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  36.41 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  37.11 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  33.89 
 
 		 196 aa  111  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  36.36 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  29.03 
 
 		 304 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  30.93 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  29.84 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  26.79 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  37.84 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  33.33 
 
 		 324 aa  55.1  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  30.89 
 
 		 291 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  32.94 
 
 		 338 aa  51.6  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2554  2OG-Fe(II) oxygenase  30.89 
 
 		 247 aa  48.9  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1127  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  23.81 
 
 		 303 aa  45.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.328998  decreased coverage  0.000557231 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45723  predicted protein  22.41 
 
 		 541 aa  41.6  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>