69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2243 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 
226 aa  476  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  62.83 
 
 
214 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  50.73 
 
 
220 aa  218  8.999999999999998e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  48.73 
 
 
210 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  43.32 
 
 
225 aa  185  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  43.5 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  45.32 
 
 
227 aa  182  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  45.27 
 
 
215 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  45.23 
 
 
207 aa  180  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  43.22 
 
 
199 aa  177  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  44.72 
 
 
207 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  44 
 
 
207 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  43.72 
 
 
207 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  43.72 
 
 
207 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  44 
 
 
199 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  44 
 
 
199 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  44 
 
 
199 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  43.72 
 
 
207 aa  174  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  41.83 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  46.91 
 
 
230 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  42.71 
 
 
207 aa  168  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  42.71 
 
 
224 aa  166  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  45.88 
 
 
209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  37.73 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  42.29 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  37.56 
 
 
217 aa  161  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  47.67 
 
 
210 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  47.18 
 
 
213 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  40 
 
 
211 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  43.52 
 
 
244 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  42.86 
 
 
200 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  42.56 
 
 
197 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  43.35 
 
 
205 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  45.88 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  46.15 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  46.15 
 
 
211 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  37.19 
 
 
203 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  40.82 
 
 
219 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  42.44 
 
 
245 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  38.12 
 
 
220 aa  148  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  40.39 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  45.64 
 
 
210 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  41.97 
 
 
233 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  40.93 
 
 
209 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  40.93 
 
 
232 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  37.85 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  41.67 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  41.14 
 
 
212 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  36.87 
 
 
196 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  30.41 
 
 
212 aa  105  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  33.83 
 
 
304 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  32.46 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  32.66 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  37.14 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  31.51 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  42.31 
 
 
126 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2554  2OG-Fe(II) oxygenase  33.59 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26414  predicted protein  33.33 
 
 
262 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0496773  normal  0.028016 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3466  2OG-Fe(II) oxygenase  30.37 
 
 
306 aa  48.5  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.413684  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1127  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.43 
 
 
303 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.328998  decreased coverage  0.000557231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3733.1  proline hydroxylase  32.65 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  32.95 
 
 
324 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3876  hypothetical protein  31 
 
 
309 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.31832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0949  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.63 
 
 
237 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0957  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.63 
 
 
238 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1813  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  29.13 
 
 
254 aa  45.8  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0923  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.63 
 
 
238 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  28.41 
 
 
338 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5157  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  28.83 
 
 
309 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.838814  normal  0.639881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>