14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1813 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1813  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  100 
 
 		 254 aa  525  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3733.1  proline hydroxylase  30.98 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0923  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.33 
 
 		 238 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0957  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.33 
 
 		 238 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0949  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.33 
 
 		 237 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2554  2OG-Fe(II) oxygenase  38.61 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04020  nucleus protein, putative  28.21 
 
 		 678 aa  49.3  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.201261  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2653  2OG-Fe(II) oxygenase  29.91 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.862511  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  29.13 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  32.32 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_94071  predicted protein  29.81 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.525512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  30.33 
 
 		 304 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  26.03 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5796  hypothetical protein  26.53 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>