27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3733.1 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3733.1  proline hydroxylase  100 
 
 		 239 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0957  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  89.87 
 
 		 238 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0923  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  89.87 
 
 		 238 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0949  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  89.41 
 
 		 237 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1813  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.98 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2554  2OG-Fe(II) oxygenase  36.59 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  35.79 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  35.79 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12896  GrpE protein, HSP90 cofactor, chloroplast targeted  28.28 
 
 		 525 aa  55.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  34 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2653  2OG-Fe(II) oxygenase  28.89 
 
 		 225 aa  52  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.862511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  34.78 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  38.3 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  35.87 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  32.65 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  25.27 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  32.98 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2547  proline hydroxylase-like protein  26.24 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  38.46 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  33 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  33.68 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  35.48 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  31.37 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0640  hypothetical protein  24.24 
 
 		 271 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07554  oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14810)  25.73 
 
 		 663 aa  42.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  hitchhiker  0.00734337 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  29.81 
 
 		 212 aa  42  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  28.72 
 
 		 219 aa  42  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>