26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2547 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2547  proline hydroxylase-like protein  100 
 
 		 277 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1651  hypothetical protein  39.91 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00915385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0640  hypothetical protein  40.27 
 
 		 271 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5183  proline hydroxylase-like protein  36.32 
 
 		 323 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000154624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1902  hypothetical protein  34.1 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0773  hypothetical protein  32.38 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1635  hypothetical protein  31.86 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464556 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3876  hypothetical protein  32.05 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.31832  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44522  predicted protein  37.21 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.431246  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3077  hypothetical protein  31.51 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3313  hypothetical protein  31.96 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106012  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3002  hypothetical protein  35.12 
 
 		 203 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5796  hypothetical protein  28.24 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0059  hypothetical protein  26.6 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382992  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  28.21 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  31.4 
 
 		 207 aa  49.7  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2245  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  27.41 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2554  2OG-Fe(II) oxygenase  26.11 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1264  hypothetical protein  24.64 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3716  SanC, putative  26.95 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.958336  normal  0.155047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1758  hypothetical protein  24.42 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.348328  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3733.1  proline hydroxylase  26.24 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  30.84 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  30.77 
 
 		 212 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12896  GrpE protein, HSP90 cofactor, chloroplast targeted  34.83 
 
 		 525 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2653  2OG-Fe(II) oxygenase  26.27 
 
 		 225 aa  42.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.862511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>