70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1461 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  100 
 
 		 207 aa  433  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  64.25 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  63.29 
 
 		 207 aa  265  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  62.8 
 
 		 207 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  63.29 
 
 		 207 aa  263  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  60.87 
 
 		 207 aa  262  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  62.8 
 
 		 207 aa  261  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  61.84 
 
 		 207 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  63.82 
 
 		 199 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  63.82 
 
 		 199 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  63.82 
 
 		 199 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  61.31 
 
 		 199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  54.59 
 
 		 224 aa  241  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  49.23 
 
 		 205 aa  194  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  44.71 
 
 		 214 aa  191  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  45.03 
 
 		 197 aa  174  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  44.28 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  45.59 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  38.92 
 
 		 220 aa  171  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  44.97 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  41.21 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  42.71 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  42 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  43.3 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  41.36 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  45.13 
 
 		 244 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  41.97 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  41.92 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  40.2 
 
 		 227 aa  154  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  43.59 
 
 		 233 aa  151  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  39.7 
 
 		 209 aa  151  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  40.59 
 
 		 232 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  41.75 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  37.69 
 
 		 212 aa  147  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  41.54 
 
 		 210 aa  147  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  38.54 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  35.71 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  42.46 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  40.8 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  35.71 
 
 		 212 aa  137  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  36.32 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  38.22 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  35.53 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  36.55 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  36.87 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  36.87 
 
 		 211 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  35.53 
 
 		 211 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  35.38 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  34.72 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  28.43 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  32.84 
 
 		 252 aa  104  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  35.14 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  30.5 
 
 		 252 aa  95.1  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  28.71 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  39.71 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  32 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  34.52 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0949  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  33.33 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0957  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  32.29 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0923  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  32.29 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3733.1  proline hydroxylase  34.78 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2547  proline hydroxylase-like protein  31.4 
 
 		 277 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26414  predicted protein  29.11 
 
 		 262 aa  49.7  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0496773  normal  0.028016 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26319  predicted protein  26.09 
 
 		 323 aa  47.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2554  2OG-Fe(II) oxygenase  31.18 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5157  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  25.35 
 
 		 309 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.838814  normal  0.639881 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48235  predicted protein  26.19 
 
 		 326 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.652945  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1127  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  22.22 
 
 		 303 aa  42  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.328998  decreased coverage  0.000557231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1635  hypothetical protein  25.49 
 
 		 299 aa  41.6  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464556 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  30.17 
 
 		 324 aa  41.6  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>