21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0949 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0949  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  100 
 
 
237 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0957  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  98.73 
 
 
238 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0923  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  98.73 
 
 
238 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3733.1  proline hydroxylase  89.41 
 
 
239 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1813  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  31.33 
 
 
254 aa  115  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2554  2OG-Fe(II) oxygenase  35.37 
 
 
247 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  35.16 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  35.16 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  33.33 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2653  2OG-Fe(II) oxygenase  27.41 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.862511  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  31 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  34.78 
 
 
207 aa  49.7  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  33.33 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  37.36 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  31.63 
 
 
226 aa  45.8  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  25.13 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12896  GrpE protein, HSP90 cofactor, chloroplast targeted  25.52 
 
 
525 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  27.66 
 
 
219 aa  42.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04020  nucleus protein, putative  26.38 
 
 
678 aa  42  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.201261  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  31.37 
 
 
211 aa  41.6  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  28.85 
 
 
212 aa  41.6  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>