63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02845 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  100 
 
 
212 aa  432  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  46.31 
 
 
203 aa  184  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  41.75 
 
 
196 aa  155  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  33.82 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  36.08 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  40 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  35.57 
 
 
232 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  37.11 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  37.63 
 
 
212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  36.08 
 
 
210 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  33.16 
 
 
251 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  35.75 
 
 
219 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  35.9 
 
 
205 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  38.31 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  38.31 
 
 
211 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  36.5 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  38.46 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  39.38 
 
 
211 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  35.71 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  31.92 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  37.11 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  34.72 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  34.65 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  36.18 
 
 
245 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  35.82 
 
 
213 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  36.04 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  34.9 
 
 
197 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  36.21 
 
 
214 aa  108  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  34.5 
 
 
207 aa  108  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  33.67 
 
 
207 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  37.11 
 
 
233 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  36.09 
 
 
215 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  34 
 
 
207 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  36.08 
 
 
199 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  38.46 
 
 
207 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  33.67 
 
 
207 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  30.41 
 
 
226 aa  105  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  32.18 
 
 
225 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  31.44 
 
 
220 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  34.85 
 
 
217 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  34.87 
 
 
220 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  34.33 
 
 
207 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  34.87 
 
 
199 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  34.36 
 
 
199 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  34.36 
 
 
199 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  35.05 
 
 
210 aa  99.4  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  33 
 
 
207 aa  96.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  35.47 
 
 
230 aa  95.9  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  35.06 
 
 
209 aa  95.5  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  32.5 
 
 
252 aa  89.4  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  32 
 
 
304 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  24.75 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  28.84 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  38.46 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  47.37 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  26.02 
 
 
291 aa  55.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  39.29 
 
 
324 aa  52  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  36.9 
 
 
338 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3733.1  proline hydroxylase  29.81 
 
 
239 aa  42  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0949  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  28.85 
 
 
237 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3876  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  41.6  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.31832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0957  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  28.85 
 
 
238 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0923  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  28.85 
 
 
238 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>