62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5391 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  76.19 
 
 		 244 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  77.62 
 
 		 233 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  77.14 
 
 		 211 aa  315  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  76.67 
 
 		 213 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  78.1 
 
 		 211 aa  310  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  78.26 
 
 		 207 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  66.18 
 
 		 209 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  67 
 
 		 232 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  63.77 
 
 		 210 aa  263  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  69.23 
 
 		 245 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  47.69 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  42.08 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  47.67 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  43.3 
 
 		 203 aa  167  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  43.28 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  46.39 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  42.56 
 
 		 220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  42.03 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  41.54 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  45.55 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  39.11 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  43.43 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  40 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  41.27 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  41.75 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  40.41 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  40.21 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  40.48 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  40.1 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  40.69 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  38.78 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  41.45 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  39.15 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  39.15 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  38.62 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  38.62 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  39.15 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  38.62 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  38.62 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  38.62 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  38.46 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  41.27 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  41.11 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  43.18 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  38.98 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  36.27 
 
 		 200 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  34.86 
 
 		 196 aa  121  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  36.5 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  71.43 
 
 		 126 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  39.52 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  36.04 
 
 		 252 aa  105  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  40.15 
 
 		 304 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  29.22 
 
 		 321 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  30.23 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48235  predicted protein  32.8 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.652945  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45723  predicted protein  27.57 
 
 		 541 aa  48.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136457  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  31.33 
 
 		 338 aa  47.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  35.71 
 
 		 324 aa  45.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26319  predicted protein  35.11 
 
 		 323 aa  45.1  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2480  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  28.83 
 
 		 300 aa  42.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.019488  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>