66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5212 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  94.69 
 
 		 207 aa  370  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  93.84 
 
 		 211 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  91 
 
 		 213 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  77.14 
 
 		 210 aa  320  8e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  65.24 
 
 		 244 aa  300  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  66.19 
 
 		 233 aa  279  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  58.94 
 
 		 209 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  58.82 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  65.99 
 
 		 245 aa  256  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  59.42 
 
 		 210 aa  245  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  47.74 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  45.41 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  41.58 
 
 		 214 aa  171  9e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  45.88 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  44.9 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  43.3 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  40.1 
 
 		 215 aa  164  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  41.23 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  44.85 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  39.9 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  41.97 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  40 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  42.29 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  39.06 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  38.19 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  39.38 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  37.56 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  44.89 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  36.87 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.79 
 
 		 199 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.79 
 
 		 199 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.79 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.79 
 
 		 199 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  37.44 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  42.11 
 
 		 230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  37 
 
 		 225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  36.79 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  35.5 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  37.63 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  36.82 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  36.41 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  40.4 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  36.18 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  35.38 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  35.75 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  34.2 
 
 		 212 aa  128  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  35.57 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  39.77 
 
 		 211 aa  124  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  33.91 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  36.36 
 
 		 252 aa  112  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  35.61 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  41.55 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  61.04 
 
 		 126 aa  97.8  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  32.12 
 
 		 321 aa  96.3  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  32.8 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48235  predicted protein  34.4 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.652945  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  36.14 
 
 		 324 aa  49.3  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  33.73 
 
 		 338 aa  48.9  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45723  predicted protein  24.32 
 
 		 541 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136457  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49288  oxidoreductase  24.22 
 
 		 415 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0949  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  35.11 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26414  predicted protein  29.33 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0496773  normal  0.028016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0957  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  35.16 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0923  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  35.16 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3733.1  proline hydroxylase  35.16 
 
 		 239 aa  42  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>