57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1526 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  99.03 
 
 		 207 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  97.58 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  90.82 
 
 		 207 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  90.82 
 
 		 207 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  87.44 
 
 		 207 aa  384  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  90.45 
 
 		 199 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  89.95 
 
 		 199 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  89.95 
 
 		 199 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  66.67 
 
 		 207 aa  291  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  68.34 
 
 		 199 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  61.35 
 
 		 224 aa  274  7e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  63.29 
 
 		 207 aa  263  8.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  47.12 
 
 		 214 aa  202  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  44.83 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  49.25 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  45.73 
 
 		 210 aa  184  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  43.07 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  43.14 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  40.39 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  43.72 
 
 		 226 aa  174  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  45.26 
 
 		 230 aa  174  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  40.98 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  43.52 
 
 		 200 aa  167  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  44.21 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  43 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  42.49 
 
 		 217 aa  158  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  38.83 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  38.34 
 
 		 230 aa  155  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  39 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  42.19 
 
 		 244 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  38.62 
 
 		 251 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  39.15 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  38.66 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  37.88 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  38.46 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  40.13 
 
 		 211 aa  128  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  41.75 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  37.31 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  37.31 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  35.78 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  36.79 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  36.76 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  35.75 
 
 		 213 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  33.5 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  32.14 
 
 		 212 aa  115  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  32.65 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  35.75 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  35.2 
 
 		 196 aa  107  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  38.46 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  35.26 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  33.33 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  34.81 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  29.06 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  27.65 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  36.9 
 
 		 338 aa  55.1  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  33.8 
 
 		 126 aa  42.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>