66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5066 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 
211 aa  430  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  99.03 
 
 
207 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  92.42 
 
 
213 aa  370  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  93.84 
 
 
211 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  78.1 
 
 
210 aa  316  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  66.19 
 
 
244 aa  297  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  67.14 
 
 
233 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  58.94 
 
 
209 aa  255  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  58.82 
 
 
232 aa  251  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  64.65 
 
 
245 aa  249  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  59.9 
 
 
210 aa  241  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  42.57 
 
 
214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  45.41 
 
 
212 aa  171  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  46.15 
 
 
226 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  42.5 
 
 
203 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  44.44 
 
 
220 aa  167  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  45.83 
 
 
219 aa  165  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  40.1 
 
 
215 aa  162  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  42.58 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  40.91 
 
 
217 aa  154  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  44.67 
 
 
209 aa  154  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  42.05 
 
 
205 aa  148  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  38.31 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  40 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  43.35 
 
 
230 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  38.86 
 
 
199 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  39.7 
 
 
210 aa  142  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  38.19 
 
 
217 aa  142  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  39.06 
 
 
197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  38.66 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  36.92 
 
 
207 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  40 
 
 
220 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  37.44 
 
 
200 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  35.53 
 
 
207 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  37 
 
 
207 aa  136  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  42.63 
 
 
230 aa  136  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  37.31 
 
 
207 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  36.27 
 
 
207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.27 
 
 
207 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  36 
 
 
227 aa  134  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.27 
 
 
199 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  36.79 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.27 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.27 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  38 
 
 
225 aa  132  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  43.18 
 
 
251 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  35.71 
 
 
212 aa  127  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  35.16 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  39.77 
 
 
211 aa  122  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  33.91 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  36.36 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  35.12 
 
 
252 aa  105  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  40.85 
 
 
304 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  60.76 
 
 
126 aa  99  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  29.76 
 
 
321 aa  88.2  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  31.55 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48235  predicted protein  33.6 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.652945  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  33.73 
 
 
338 aa  52  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45723  predicted protein  26.49 
 
 
541 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136457  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  34.94 
 
 
324 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49288  oxidoreductase  24.07 
 
 
415 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26414  predicted protein  32 
 
 
262 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0496773  normal  0.028016 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2480  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  28.83 
 
 
300 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.019488  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0949  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.17 
 
 
237 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1635  hypothetical protein  27.42 
 
 
299 aa  41.6  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3024  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  26.92 
 
 
208 aa  41.6  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>