62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0403 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  93.75 
 
 		 232 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  67.33 
 
 		 244 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  66.18 
 
 		 210 aa  262  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  65.22 
 
 		 210 aa  261  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  68.32 
 
 		 233 aa  260  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  65.13 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  58.94 
 
 		 211 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  59.42 
 
 		 207 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  58.45 
 
 		 213 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  58.94 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  43.65 
 
 		 212 aa  174  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  93.9 
 
 		 126 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  43.78 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  40.5 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  42.5 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  41.75 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  41.41 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  38.61 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  37.62 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  40.93 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  40.93 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  39.18 
 
 		 224 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  38.27 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  36.08 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  35.96 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  37.37 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  37.68 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  38.07 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  36.68 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  37.76 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  37.76 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  37.76 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  37.76 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  38.66 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  34.83 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  37.07 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  37.31 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  37.31 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  36.79 
 
 		 205 aa  121  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  36.79 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  35.53 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  34.72 
 
 		 200 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  39.66 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  41.14 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  32.37 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  35.23 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  36.45 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  34.52 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  34.83 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  35 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  34.3 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  33.82 
 
 		 252 aa  91.3  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  30.14 
 
 		 321 aa  84.7  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  31.77 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  30.91 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48235  predicted protein  32 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.652945  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  34.94 
 
 		 324 aa  50.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45723  predicted protein  25.39 
 
 		 541 aa  48.5  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136457  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26414  predicted protein  33 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0496773  normal  0.028016 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26319  predicted protein  37.89 
 
 		 323 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  36.14 
 
 		 338 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>