59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003576 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  100 
 
 		 197 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  87.24 
 
 		 200 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  66.5 
 
 		 205 aa  284  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  47.37 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  45.03 
 
 		 207 aa  174  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  45.26 
 
 		 207 aa  174  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  44.68 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  43.56 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  44.21 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  44.21 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  45 
 
 		 230 aa  165  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  43.94 
 
 		 223 aa  165  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  43.16 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  42.63 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  42.63 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  42.63 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  42.63 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  43.98 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  43.68 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  45.5 
 
 		 217 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  42.41 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  46.51 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  42.56 
 
 		 226 aa  153  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  38.92 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  44.5 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  40.93 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  41.29 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  44.72 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  37.69 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  40.98 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  46.15 
 
 		 209 aa  143  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  39.06 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  37.63 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  37.1 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  39.58 
 
 		 245 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  39.8 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  39.06 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  38.78 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  37.04 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  36.73 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  37.37 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  39.58 
 
 		 213 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  39.58 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  39.06 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  39.2 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  39.06 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  37.91 
 
 		 211 aa  121  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  34.72 
 
 		 219 aa  111  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  34.81 
 
 		 196 aa  111  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  34.9 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  31.72 
 
 		 304 aa  94  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  31.98 
 
 		 252 aa  91.7  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  29.95 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  29.27 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  37.84 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  34.52 
 
 		 324 aa  58.2  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  30.89 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  34.12 
 
 		 338 aa  53.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3466  2OG-Fe(II) oxygenase  28.89 
 
 		 306 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.413684  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>