62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_04050 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  100 
 
 
232 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  93.75 
 
 
209 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  64.32 
 
 
244 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  66.99 
 
 
233 aa  265  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  67 
 
 
210 aa  261  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  64.25 
 
 
210 aa  256  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  63.59 
 
 
245 aa  237  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  58.82 
 
 
211 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  59.31 
 
 
213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  59.61 
 
 
207 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  58.82 
 
 
211 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  43.94 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  100 
 
 
126 aa  172  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  41.5 
 
 
203 aa  155  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  44.16 
 
 
220 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  43.81 
 
 
219 aa  151  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  40.59 
 
 
207 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  38.54 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  39.8 
 
 
215 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  40.93 
 
 
226 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  37.62 
 
 
223 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  38.81 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  38.07 
 
 
207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  39.39 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  37.31 
 
 
217 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  37.04 
 
 
197 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  35.57 
 
 
212 aa  128  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  33.64 
 
 
227 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  38 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  36.14 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  37.62 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  38.69 
 
 
230 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  35.82 
 
 
207 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.55 
 
 
199 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.55 
 
 
199 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.55 
 
 
199 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  35.78 
 
 
207 aa  123  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  35.64 
 
 
209 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  35.78 
 
 
207 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  36.04 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  36.32 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  36.46 
 
 
205 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  33.85 
 
 
200 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  41.14 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  35.48 
 
 
196 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  37.64 
 
 
212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  38.22 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  36 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  33.5 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  37.99 
 
 
251 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  39.88 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  33.99 
 
 
252 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  33.5 
 
 
252 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  30.05 
 
 
321 aa  79  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  31.75 
 
 
304 aa  78.6  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  36.22 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48235  predicted protein  31.2 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.652945  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  36.14 
 
 
324 aa  52.4  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26319  predicted protein  37.89 
 
 
323 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45723  predicted protein  24.51 
 
 
541 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136457  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26414  predicted protein  33 
 
 
262 aa  45.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0496773  normal  0.028016 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  34.94 
 
 
338 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>