19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3466 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3466  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 306 aa  631  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.413684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5157  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  50.77 
 
 		 309 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.838814  normal  0.639881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1127  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  51.79 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.328998  decreased coverage  0.000557231 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2480  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  48.42 
 
 		 300 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.019488  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2404  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  41.78 
 
 		 457 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3024  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  29.15 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2659  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.43 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00638484  decreased coverage  0.00126979 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  29.11 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  29.46 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  30.37 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  26.34 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  28.24 
 
 		 291 aa  45.8  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  29.06 
 
 		 219 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  27.03 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  29.82 
 
 		 205 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  28.32 
 
 		 211 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  32.67 
 
 		 210 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  28 
 
 		 252 aa  42.7  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  28.44 
 
 		 210 aa  42.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>