17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45723 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45723  predicted protein  100 
 
 
541 aa  1121    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136457  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  22.47 
 
 
304 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26414  predicted protein  34.13 
 
 
262 aa  55.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0496773  normal  0.028016 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  33.57 
 
 
321 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  27.68 
 
 
291 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.39 
 
 
209 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  28.45 
 
 
252 aa  48.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  27.68 
 
 
252 aa  47.8  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  22.6 
 
 
212 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  24.51 
 
 
232 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  25.42 
 
 
230 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  25.94 
 
 
324 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  22.69 
 
 
212 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  22.95 
 
 
225 aa  44.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  35.63 
 
 
212 aa  44.3  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  30.83 
 
 
210 aa  44.3  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  25.93 
 
 
203 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>