19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3077 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3077  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  565  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3313  hypothetical protein  89.26 
 
 		 273 aa  501  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106012  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1635  hypothetical protein  34.25 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464556 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44522  predicted protein  32.34 
 
 		 352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.431246  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3876  hypothetical protein  33.64 
 
 		 309 aa  125  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.31832  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1651  hypothetical protein  30.13 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00915385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2547  proline hydroxylase-like protein  31.51 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1902  hypothetical protein  34.01 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0773  hypothetical protein  30.83 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0640  hypothetical protein  29.01 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3002  hypothetical protein  31.77 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5183  proline hydroxylase-like protein  27.31 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000154624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0059  hypothetical protein  27.23 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382992  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5796  hypothetical protein  29.37 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12896  GrpE protein, HSP90 cofactor, chloroplast targeted  24.79 
 
 		 525 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  43.08 
 
 		 215 aa  45.4  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  35.9 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  29.45 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  33.68 
 
 		 223 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>