21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1651 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1651  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00915385 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1902  hypothetical protein  36.95 
 
 
279 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0640  hypothetical protein  40.79 
 
 
271 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1635  hypothetical protein  36.29 
 
 
299 aa  162  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2547  proline hydroxylase-like protein  39.91 
 
 
277 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44522  predicted protein  35.66 
 
 
352 aa  159  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.431246  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3876  hypothetical protein  32.23 
 
 
309 aa  132  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.31832  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0773  hypothetical protein  31.54 
 
 
278 aa  132  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3077  hypothetical protein  30.13 
 
 
273 aa  123  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3313  hypothetical protein  31.06 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5183  proline hydroxylase-like protein  31.39 
 
 
323 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000154624 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5796  hypothetical protein  29.52 
 
 
285 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3002  hypothetical protein  33.68 
 
 
203 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0059  hypothetical protein  26.96 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382992  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  42.65 
 
 
212 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  42.65 
 
 
212 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1507  hypothetical protein  27.31 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1832  hypothetical protein  27.31 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.219625  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2309  hypothetical protein  23.63 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496757  hitchhiker  0.00288669 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44460  hypothetical protein  21.89 
 
 
238 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416681  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>