21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5183 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5183  proline hydroxylase-like protein  100 
 
 
323 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000154624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2547  proline hydroxylase-like protein  36.32 
 
 
277 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0640  hypothetical protein  33.48 
 
 
271 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1651  hypothetical protein  31.39 
 
 
268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44522  predicted protein  28.98 
 
 
352 aa  109  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.431246  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1902  hypothetical protein  33.77 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3876  hypothetical protein  29.24 
 
 
309 aa  95.9  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.31832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3077  hypothetical protein  27.31 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0773  hypothetical protein  27.8 
 
 
278 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3313  hypothetical protein  26.79 
 
 
273 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106012  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1635  hypothetical protein  29.55 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464556 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0059  hypothetical protein  26.84 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382992  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5796  hypothetical protein  26.55 
 
 
285 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3002  hypothetical protein  28.85 
 
 
203 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1832  hypothetical protein  23.08 
 
 
260 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.219625  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1507  hypothetical protein  23.08 
 
 
260 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1895  hypothetical protein  25 
 
 
270 aa  50.1  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0297003  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4036  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  21.74 
 
 
224 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3716  SanC, putative  22.8 
 
 
219 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.958336  normal  0.155047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0484  FkbM family methyltransferase  23.45 
 
 
707 aa  43.5  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44460  hypothetical protein  21.65 
 
 
238 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>