18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4036 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4036  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  100 
 
 		 224 aa  466  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2245  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  26.55 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3716  SanC, putative  25.66 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.958336  normal  0.155047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1851  hypothetical protein  24.89 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0668  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  24.44 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3432  hypothetical protein  26.44 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  0.242236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2309  hypothetical protein  24.39 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496757  hitchhiker  0.00288669 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1758  hypothetical protein  30.97 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.348328  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1507  hypothetical protein  27.35 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1832  hypothetical protein  27.35 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.219625  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1264  hypothetical protein  34.91 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44460  hypothetical protein  27.65 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416681  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2128  hypothetical protein  25.45 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5183  proline hydroxylase-like protein  21.74 
 
 		 323 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000154624 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1895  hypothetical protein  23.79 
 
 		 270 aa  45.4  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0297003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3549  hypothetical protein  29.27 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  31.76 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0640  hypothetical protein  20.09 
 
 		 271 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>