14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2309 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2309  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  539  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496757  hitchhiker  0.00288669 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1264  hypothetical protein  46.36 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2128  hypothetical protein  42.45 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0668  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  42.57 
 
 		 210 aa  178  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1851  hypothetical protein  42.57 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1758  hypothetical protein  38.29 
 
 		 227 aa  172  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.348328  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3432  hypothetical protein  39.9 
 
 		 210 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  0.242236 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0371  hypothetical protein  38.83 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2115  hypothetical protein  39.41 
 
 		 215 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3549  hypothetical protein  34.98 
 
 		 229 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4036  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  24.39 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1265  hypothetical protein  27.7 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2131  hypothetical protein  32.28 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1651  hypothetical protein  23.63 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00915385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>