17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0668 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0668  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  100 
 
 		 210 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1851  hypothetical protein  94.76 
 
 		 210 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3432  hypothetical protein  83.81 
 
 		 210 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  0.242236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1758  hypothetical protein  45.05 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.348328  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2309  hypothetical protein  42.57 
 
 		 259 aa  178  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496757  hitchhiker  0.00288669 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2128  hypothetical protein  39.71 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1264  hypothetical protein  38.83 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0371  hypothetical protein  30.95 
 
 		 213 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2115  hypothetical protein  30.81 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3549  hypothetical protein  30.57 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4036  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  24.44 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1507  hypothetical protein  27.42 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1832  hypothetical protein  27.42 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.219625  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  36.99 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2245  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  27.42 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3716  SanC, putative  27.97 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.958336  normal  0.155047 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3876  hypothetical protein  25.68 
 
 		 309 aa  42.4  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.31832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>