15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1264 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1264  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  460  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2309  hypothetical protein  46.36 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496757  hitchhiker  0.00288669 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2128  hypothetical protein  46.04 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2115  hypothetical protein  44.55 
 
 		 215 aa  177  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0371  hypothetical protein  43.9 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0668  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  38.83 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1851  hypothetical protein  38.83 
 
 		 210 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3432  hypothetical protein  37.56 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  0.242236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1758  hypothetical protein  39.9 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.348328  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3549  hypothetical protein  35.47 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4036  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.91 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2245  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  30.15 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1265  hypothetical protein  26.62 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2547  proline hydroxylase-like protein  24.64 
 
 		 277 aa  45.1  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2131  hypothetical protein  27.59 
 
 		 223 aa  42  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>